Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ythdc2B2RR83 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ythdc2B2RR83 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms