Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Phf3B2RQG2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf3B2RQG2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms