Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CK137956B1AYM9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms