Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms