Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtpruB1AUH1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtpruB1AUH1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtpruB1AUH1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtpruB1AUH1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtpruB1AUH1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpruB1AUH1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpruB1AUH1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpruB1AUH1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpruB1AUH1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpruB1AUH1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpruB1AUH1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpruB1AUH1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpruB1AUH1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpruB1AUH1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpruB1AUH1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtpruB1AUH1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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