Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Trabd2bB1ATG9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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Trabd2bB1ATG9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Trabd2bB1ATG9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Trabd2bB1ATG9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms