Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms