Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms