Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Prr16A3KMN5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Prr16A3KMN5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr16A3KMN5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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