Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc9bA3KGF9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms