Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pm20d2A3KG59 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pm20d2A3KG59 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pm20d2A3KG59 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pm20d2A3KG59 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pm20d2A3KG59 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms