Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms