Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms