Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms