Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms