Protein–RNA interactions for Protein: A2AVZ9

Slc43a3, Solute carrier family 43 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a3A2AVZ9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc43a3A2AVZ9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc43a3A2AVZ9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc43a3A2AVZ9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc43a3A2AVZ9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc43a3A2AVZ9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc43a3A2AVZ9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc43a3A2AVZ9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc43a3A2AVZ9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc43a3A2AVZ9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc43a3A2AVZ9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc43a3A2AVZ9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc43a3A2AVZ9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms