Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GabreA2AMW3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GabreA2AMW3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms