Protein–RNA interactions for Protein: A2ALU4

Shroom2, Protein Shroom2, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom2A2ALU4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Shroom2A2ALU4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Shroom2A2ALU4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Shroom2A2ALU4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Shroom2A2ALU4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Shroom2A2ALU4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Shroom2A2ALU4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Shroom2A2ALU4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shroom2A2ALU4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms