Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms