Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms