Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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