Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn22Q9D7U6 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Cldn22Q9D7U6 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms