Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Pramef12Q9D2F1 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms