Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Smpd4-203ENSMUST00000090159 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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PtprtQ99M80 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Olfr1350-203ENSMUST00000219278 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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PtprtQ99M80 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Zfp286-201ENSMUST00000054654 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Olfr63-203ENSMUST00000217023 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Pcdhb11-201ENSMUST00000053073 4419 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms