Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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Rab28Q99KL7 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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Rab28Q99KL7 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab28Q99KL7 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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