Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ankfn1-203ENSMUST00000169201 2232 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms