Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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