Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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