Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Ctf2-201ENSMUST00000076091 1754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Klrb1b-201ENSMUST00000032472 2228 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm28410-201ENSMUST00000188113 1450 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm28852-201ENSMUST00000186666 2160 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Rnase13-201ENSMUST00000089771 1412 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Ctse-202ENSMUST00000112411 1837 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm8173-201ENSMUST00000186797 1977 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Abhd12b-206ENSMUST00000182927 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Rufy3-207ENSMUST00000199312 2182 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 St3gal6-201ENSMUST00000114357 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Inca1-204ENSMUST00000108543 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm14094-201ENSMUST00000117717 610 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Hk1os-202ENSMUST00000142968 343 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm22484-201ENSMUST00000157992 306 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Slc15a2-205ENSMUST00000164579 1068 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm8696-201ENSMUST00000174777 385 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Scgb1b12-201ENSMUST00000188355 417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Rarres2-204ENSMUST00000204267 795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm30781-201ENSMUST00000204743 216 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Rarres2-205ENSMUST00000204930 681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm45295-201ENSMUST00000210393 1046 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm1943-201ENSMUST00000211890 174 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 CT009509.1-201ENSMUST00000223855 466 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 AC124686.1-201ENSMUST00000225546 522 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Bcl2a1d-201ENSMUST00000098486 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm4858-203ENSMUST00000195847 1451 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Ldb2-207ENSMUST00000199534 2541 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Jam2-202ENSMUST00000114195 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gramd4-201ENSMUST00000088931 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Lipc-204ENSMUST00000216798 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Tmem144-201ENSMUST00000029568 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mkrn3Q60764 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms