Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 354.6 ms