Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms