Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms