Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
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Ttc39dQ0VF76 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ttc39dQ0VF76 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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Ttc39dQ0VF76 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ttc39dQ0VF76 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ttc39dQ0VF76 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ttc39dQ0VF76 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ttc39dQ0VF76 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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Ttc39dQ0VF76 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ttc39dQ0VF76 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ttc39dQ0VF76 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ttc39dQ0VF76 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ttc39dQ0VF76 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ttc39dQ0VF76 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ttc39dQ0VF76 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ttc39dQ0VF76 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ttc39dQ0VF76 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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