Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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