Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SftpdP50404 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms