Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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