Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gcnt2-201ENSMUST00000067778 4038 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Tas1r3-201ENSMUST00000030949 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Hoxd10P28359 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Hoxd10P28359 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Hoxd10P28359 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Hoxd10P28359 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Hoxd10P28359 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Hoxd10P28359 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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Hoxd10P28359 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms