Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm6236-201ENSMUST00000193785 1009 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Lrrc8dos-201ENSMUST00000135958 586 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TtrP07309 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TtrP07309 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TtrP07309 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
TtrP07309 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TtrP07309 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TtrP07309 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TtrP07309 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TtrP07309 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms