Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P01641 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01641 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01641 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms