Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Ccl20O89093 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Ccl20O89093 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Ccl20O89093 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Ccl20O89093 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Ccl20O89093 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Ccl20O89093 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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