Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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H2-Q1O19441 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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H2-Q1O19441 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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H2-Q1O19441 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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H2-Q1O19441 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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H2-Q1O19441 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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H2-Q1O19441 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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H2-Q1O19441 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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H2-Q1O19441 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
H2-Q1O19441 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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