Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cldn34c4A2ANA3 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms