Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Creb1-202ENSMUST00000087366 8364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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PtprtQ99M80 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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PtprtQ99M80 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PtprtQ99M80 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PtprtQ99M80 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PtprtQ99M80 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PtprtQ99M80 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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PtprtQ99M80 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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PtprtQ99M80 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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PtprtQ99M80 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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PtprtQ99M80 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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