Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Tgfb3-201ENSMUST00000003687 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms