Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxa13Q62424 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxa13Q62424 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxa13Q62424 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxa13Q62424 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxa13Q62424 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxa13Q62424 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxa13Q62424 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxa13Q62424 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxa13Q62424 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Hoxa13Q62424 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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Hoxa13Q62424 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Hoxa13Q62424 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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Hoxa13Q62424 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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