Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13128-201ENSMUST00000105751 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Creb5-202ENSMUST00000203487 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Cald1-204ENSMUST00000115026 4080 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Dis3l2-201ENSMUST00000065694 3085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Atp4a-201ENSMUST00000005692 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Trim17-202ENSMUST00000075141 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx39-206ENSMUST00000172396 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Dync1i2-206ENSMUST00000112140 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc16-205ENSMUST00000161089 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45205-201ENSMUST00000205745 3330 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Fmr1-202ENSMUST00000114653 4058 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap45-203ENSMUST00000105373 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Hdac7-206ENSMUST00000119670 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 L3mbtl2-201ENSMUST00000023029 3487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ndrg1-201ENSMUST00000005256 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29507-201ENSMUST00000187378 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13108-201ENSMUST00000122287 1455 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox4f-201ENSMUST00000115170 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35106-201ENSMUST00000192731 250 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv8-22-201ENSMUST00000199501 367 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43139-201ENSMUST00000199914 284 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Mylpf-201ENSMUST00000032910 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Brip1os-202ENSMUST00000143819 2604 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Cfap65-201ENSMUST00000094844 5727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40999-201ENSMUST00000222586 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Fam186b-201ENSMUST00000109100 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Syncrip-211ENSMUST00000174688 3176 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ctns-201ENSMUST00000006103 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Scgn-201ENSMUST00000021770 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Eif2d-203ENSMUST00000112446 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Cdh1-201ENSMUST00000000312 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr333-ps1-202ENSMUST00000218459 1993 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gimap6-201ENSMUST00000053661 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 CT010465.1-202ENSMUST00000221816 1355 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Lipe-204ENSMUST00000149349 3713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14653-201ENSMUST00000122069 1533 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Lin54-202ENSMUST00000123572 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc7-202ENSMUST00000076467 2785 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21188-203ENSMUST00000224713 1669 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Abcc12-205ENSMUST00000152438 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf9-203ENSMUST00000165526 3593 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Fam45a-201ENSMUST00000025957 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Mir5135-201ENSMUST00000174997 79 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5313-201ENSMUST00000182893 987 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms