Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 CT030170.7-201ENSMUST00000223372 103 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Lgals8-207ENSMUST00000143693 2457 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Eif2ak4-206ENSMUST00000110874 5298 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Olfr650-ps1-201ENSMUST00000121432 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm38249-201ENSMUST00000192560 2321 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Ap3m2-204ENSMUST00000210656 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Serping1-201ENSMUST00000023994 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Olfr1509-202ENSMUST00000205900 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm16121-201ENSMUST00000128520 2253 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 AC131743.4-201ENSMUST00000221638 1553 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Pes1-202ENSMUST00000109985 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Pes1-201ENSMUST00000020705 2911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 4930543E12Rik-202ENSMUST00000210408 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Ttc37-201ENSMUST00000091466 5381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Olfr559-201ENSMUST00000084816 1022 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms