Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms