Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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NcstnP57716 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NcstnP57716 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NcstnP57716 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NcstnP57716 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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NcstnP57716 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcstnP57716 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcstnP57716 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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NcstnP57716 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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NcstnP57716 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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NcstnP57716 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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NcstnP57716 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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NcstnP57716 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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NcstnP57716 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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NcstnP57716 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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NcstnP57716 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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NcstnP57716 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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NcstnP57716 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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NcstnP57716 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcstnP57716 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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