Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm43890-201ENSMUST00000203437 2799 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gabrq-202ENSMUST00000114553 4943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Adgrf2-201ENSMUST00000113614 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms